Дело против математика возбудили еще 7 августа. По версии следствия, Мифтахов — «активный участник» террористической организации «Народная самооборона». Следователь заявил, что с апреля по май он совершил умышленно пропагандировал терроризм среди заключенных. Против аспиранта дали показания другие осужденные, которые отбывали наказание с ним. Они заявили, что после окончания срока он собирается покинуть страну. Один из свидетелей в ходе допроса пояснил, что Азат «поддерживает идеологию радикального анархизма». По словам свидетеля, 21 мая во время просмотра новостей, где говорилось о войне, Мифтахов сказал, что «будет мстить» за смерть своего друга, который погиб, воюя на стороне Украины. Другой заключенный на допросе заявил, что 30 апреля во время вечерних новостей математик сказал, что «не хочет участвовать в просмотре» и что «ФСБшников надо взрывать». Засекреченный свидетель заявил, что математик одобрил поступок анархиста Михаила Жлобицкого, устроившего взрыв в архангельском ФСБ. При этом Мифтахов в разговоре с матерью отрицал сам факт такого разговора. Адвокат указала, что следователь не представил необходимых документов, а также никак не обосновал свое утверждение, что Мифтахов попытается скрыться от следствия. Азата Мифтахова задержали в 2019 году по делу о хулиганстве. Его обвинили в том, что он и его знакомые-анархисты якобы разбили окно офиса «Единой России» в районе Ховрино и бросили туда дымовую шашку. В январе 2021 года Мифтахова приговорили к шести годам колонии общего режима. В августе 2023 года Росфинмониторинг внес математика в перечень экстремистов и террористов. 4 сентября, в день освобождения, Мифтахова задержали на выходе из ИК-17 в Омутнинске. Позже математику предъявили обвинение в оправдании терроризма.
