Ему предъявлено еще две статьи: об участии в создании и деятельности вооруженных формирований и о незаконном пересечении государственной границы. Спецслужба проводит предварительное расследование «многочисленных террористических преступлений, совершенных незаконными армянскими вооруженными формированиями, действующими на территории российского миротворческого контингента». Как утверждает Служба госбезопасности, в сентябре 2022 года Варданян «незаконно пересек» границу Азербайджана вне пунктов пропуска «с целью совершения террористических актов и диверсий».