Российское ведомство называет представителей ZOiS «псевдоаналитиками, продвигающими идеи ненависти к нашей стране». «Истинные цели Центра — инициирование антироссийских настроений, дискредитация авторитета России на международной арене, дестабилизация общественно-политической обстановки внутри нашей страны, пропаганда информации, искажающей историю российского государства», — пишет Генпрокуратура. Ведомство считает, что ZOiS собирает информацию о работе органов власти и о внутриполитических процессах, на основе чего «по западным методичкам» готовит доклады, «искажающие реальное положение дел» в России. Сам ZOiS позиционирует себя как независимый международный научно-исследовательский институт, финансируемый государством. Он проводит социальные исследования в Восточной Европе и передает информацию СМИ и политикам, сказано на сайте ZOiS.