Глава Совбеза Патрушев предупреждал Путина, что ставка на Пригожина в войне с Украиной дает последнему все больше влияния. Путин не прислушался к его словам, так как ЧВК «Вагнер» добилась успехов на поле боя.
В октябре 2022 года Пригожин позвонил Путину и в грубой форме пожаловался на дефицит боеприпасов. Патрушев счел, что Пригожин перестал уважать власть Кремля. В июне 2023 года, когда глава ЧВК начал мятеж, Патрушев «взял управление на себя».
Он просил симпатизирующих Пригожину офицеров убедить главу ЧВК прекратить мятеж. Также Патрушев обратился к президенту Казахстана Касым-Жомарту Токаеву с просьбой стать посредником в конфликте, но тот отказался.
После мятежа Патрушев приступил к разработке убийства. Путин знал об этих планах, но не стал возражать. 23 августа под крыло самолета Пригожина заложили бомбу.
Через полчаса после взлета бомба взорвалась. Все пассажиры самолета погибли.