Дело в отношении Бородина было возбуждено следственным департаментом МВД в конце 2010 года. Его подозревают в мошенничестве со средствами городского бюджета на 12,76 млрд рублей через кредит ЗАО «Премьер Эстейт», который выдал Банк Москвы. Бородин объявлен в международный розыск.